С начала 2 сезон, Часть II

После возвращения Ёсиро в родной город спокойствие прежней жизни быстро исчезает, поскольку воспоминания о прошлом продолжают преследовать его практически ежедневно. Академия, куда герой снова поступает учиться, хранит множество тайн, связанных с древними магическими силами и событиями, о которых преподаватели предпочитают молчать. Во время общения с друзьями Ёсиро постепенно замечает изменения вокруг знакомых людей, скрывающих собственные переживания, страхи и причины поступков.

Отношения между ним, Сакурой и Нодокой становятся всё напряжённее, поскольку каждая девушка по-своему связана с произошедшими ранее событиями. Сакура пытается сохранить прежнюю близость с Ёсиро, однако её действия всё чаще сопровождаются скрытностью и странными разговорами, касающимися прошлого Академии. Нодока, напротив, старается держаться спокойнее, хотя постепенно выясняется, что её семья имеет отношение к магическим ритуалам, проводившимся много лет назад. Появление необъяснимых явлений нарушает привычную жизнь учеников, заставляя администрацию скрывать происходящее от остальных жителей города.