Небесный Фафнир: Мёртвый агрессор — По ту сторону

После событий предыдущей части Тоуя Мицуги приходит в сознание в неизвестном месте, не понимая, каким образом оказался в новой реальности, где окружающий мир напоминает его прошлый, но отличается важными деталями, связанными с судьбами знакомых людей. Он быстро обнаруживает, что перед ним альтернативное измерение, в котором многие события развивались иначе, из-за чего некоторые погибшие товарищи здесь продолжают жить, занимая роли, которых не имели ранее. Особое потрясение вызывает встреча с Мией, ставшей его сестрой в этом мире, где история их семьи складывалась совершенно по-другому.

Пока он пытается разобраться в происходящем, появляются неизвестные силы, преследующие его как носителя данных, связанных с природой Фафнира, хотя сам герой не понимает, какие сведения скрыты в его сознании после столкновения с существами из первой части. Вскоре он сталкивается с драконами, отличающимися от тех, что существовали в прошлом мире, ведь здесь они обладают необычной структурой, реагирующей на присутствие Тоуи, будто воспринимают его как связующее звено между двумя измерениями. Пытаясь понять причину изменений, он присоединяется к группе местных бойцов, занимающихся исследованием угроз, создаваемых неизвестными существами, проникшими в этот мир из-за нестабильности межпространственного барьера.